除了口腔不卫生、精神压力大、内分泌失调等原因外，偏食导致的营养缺乏也会造成口腔溃疡。
与口腔溃疡关系最密切的营养素是B族维生素（特别是维生素B2）。此外，缺乏维生素C也会增加口腔溃疡的几率。有时候，口腔溃疡反复发作，而且补充维生素后效果不佳，此时要想到锌缺乏的可能，因为缺锌会影响溃疡愈合。
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