(1)胃肠道：若是胃肠道的血管受累及，就可以造成腹部和胃肠的病变。胃肠道可发生多发性溃疡，以回肠和盲肠相接的回盲部多见。临床表现为腹痛、腹泻、出血、穿孔，并可以反复发作。有的病人仅注意到白塞病的眼、口、生殖器部位的病变，而忽略了腹痛可能是本病的又一个重要表现。当病人右下腹疼痛时，往往误诊为阑尾炎而手术，或误诊为克隆病或溃疡性结肠炎。有的病人术后切开处经久不愈，造成肠瘘、肠腔狭窄等后遗症。所以，当白塞病病人有右下腹疼痛时要想到是否为白塞病的肠病表现。
(2)脑部：少数病人会有中枢神经受累。产生脑膜炎、脑炎、偏瘫、颅压升高，以及锥体束、小脑脑干、脊髓、脑神经等受损的症状。病人可有意识障碍、瘫痪、行动不稳、感觉失常等。出现脑部受累者表明病情严重。
(3)大血管：少数病人有大动脉和大静脉的狭窄、闭塞和血栓形成。肺动脉受影响导致肺动脉高压、肺出血，肢体动脉检塞导致尹指和足趾末端坏死及无脉，俗称无脉症。